三种核小体重塑的类型
- 滑动（slide）
- 核小体沿着 DNA 滑动，暴露蛋白结合位点
- 弹出（eject）
- 直接将核小体从 DNA 中弹出（核小体-1），露出更大的开放 DNA
- 交换（exchange）
- 交换不同的组蛋白变体
核小体重塑复合体
- ATP 依赖的大蛋白复合体
- 组蛋白结合结构域
- 转位酶结构域
机制
- 复合体通过 Bromodomain等结构域，识别并结核核小体
- 通过转位酶结构域，将一侧的 Linker DNA 拉进核小体
- 核小体上的 DNA 因此形成一个突环（被拉进来的 DNA 挤开）
- 在转位酶的帮助下，突环沿着核小体移动，直到核小体 DNA 的结合状态恢复正常（突环移动到另一侧的 Linker DNA）
类型
| 类型 | 组蛋白结合结构域 |
|---|---|
| SWI/SNF | bromo（Ac） |
| ISWI | bromo, SANT, PHD finger |
| CHD | Chromo（Me）, SANT, PHD finger |
| INO80 | bromo |
| 以上几种复合体均可以 slide，但只有 SWI/SNF, CHD 可以进行 transfer aka eject |
蛋白依赖的核小体定位
- 通过蛋白质的协助，核小体可以被定位
- 占位
- 两个蛋白占据一段小于 147bp 的 DNA，导致该段 DNA 的长度不足以形成核小体
- 募集
- 蛋白结合 DNA 后，结合并募集核小体